По информации Росморпорта, с 1 ноября 2015 года в морских портах Большой порт Санкт-Петербург, Выборг, Высоцк, Пассажирский порт Санкт-Петербург, Приморск и Усть-Луга взимается сбор транспортной безопасности акватории морского порта за соответствующие услуги, оказываемые ФГУП «Росморпорт». Сбор взимается в соответствии с приказом Минтранса России от 31.10.2012 № 387 «Об утверждении перечня портовых сборов, взимаемых в морских портах Российской Федерации».
В Большом порту Санкт-Петербург ставка сбора для судов загранплавания составляет для контейнеровозов 0,63 руб./GT, для ро-ро судов – 0,34 руб./GT, для наливных – 0,99 руб./GT и для остальных судов – 0,9 руб./GT.